يستخدم في علاج بعض أنواع الالتهابات الشديدة التي تسببها الجراثيم (البكتيريا) سلبية الغرام مثل: التهاب العظام عدوى الجهاز التنفسي التهاب الشغاف (الغلاف الداخلي للقلب) تسمم الدم قد يستخدم الأميكاسين في بعض أنواع الالتهابات التي تسببها المتفطرات (Mycobacteria) التي تظهر حساسية للعلاج. قد يستخدم العلاج في استخدامات أخرى يحددها الطبيب.